280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1550 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  50.81 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  51.59 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  49.19 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  50.4 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  49.6 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  51.97 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  43.41 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  49.18 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  48.39 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  45.97 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  47.29 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  60 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  46.77 
 
 		 128 aa  103  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  42.4 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  50.91 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5917  protein of unknown function UPF0102  46.03 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  49.57 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  46.88 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  43.08 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  41.44 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  41.13 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  51.38 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  43.65 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  55.17 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  41.09 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  46.36 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  37.8 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  37.8 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  49.58 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  48.18 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  42.4 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  46.62 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  43.09 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  42.4 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  43.2 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  41.86 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  53.25 
 
 		 207 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2532  protein of unknown function UPF0102  46.77 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.69 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  39.1 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  45.36 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  40.94 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  43.44 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  37.6 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  39.52 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  40.19 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  44 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  48.89 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  38.64 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  35.2 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1521  protein of unknown function UPF0102  41.09 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0637187  normal  0.0119716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  38.02 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  37.78 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  43.2 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  41.67 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  38.02 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  32.79 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  31.97 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  39.84 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  37.8 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  46.3 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.23 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  38.52 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  37.01 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  41.51 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.99 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  42.86 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  49.41 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  32.54 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  31.75 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  37.19 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  36.92 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  38.46 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  41.49 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  37.19 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.98 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  41.98 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  37.12 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0639  conserved hypothetical protein TIGR00252  34.51 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.372666 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  41.9 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  36.22 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  36.51 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>