More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0543 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0543  cation transporter  100 
 
 
467 aa  919    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2080  cation transporter  35.62 
 
 
516 aa  246  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0741  cation transporter  35.6 
 
 
480 aa  233  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0763213  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1217  cation transporter  35.18 
 
 
513 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1243  cation transporter  36.71 
 
 
480 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0203021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0148  cation transporter  35.76 
 
 
480 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00083955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0675  cation transporter  35.76 
 
 
480 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343357  normal  0.07421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1260  cation transporter  37.03 
 
 
493 aa  226  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1042  cation transporter  35.23 
 
 
533 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  31.88 
 
 
466 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  31.65 
 
 
481 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  33.41 
 
 
479 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  34.02 
 
 
481 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0548  Trk-type K+ transport systems membrane subunit  33.5 
 
 
485 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0255  cation transporter  34.79 
 
 
497 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0664504 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  33.54 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  33.54 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1727  TrkH family potassium uptake protein  32.01 
 
 
495 aa  200  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000434576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4119  cation transporter  36.73 
 
 
511 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1935  cation transporter  32.18 
 
 
485 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.282377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1687  cation transporter  36.43 
 
 
498 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.161791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1654  TrkH family potassium uptake protein  31.24 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.3 
 
 
479 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0172  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  31.75 
 
 
493 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  33.33 
 
 
476 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  30.92 
 
 
478 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  30.48 
 
 
482 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  33.08 
 
 
485 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1921  cation transporter  35.57 
 
 
514 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.898153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  29.92 
 
 
524 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  31.45 
 
 
491 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  32.25 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0635  cation transporter  32.52 
 
 
479 aa  180  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0240  cation transporter  30.39 
 
 
503 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  31.74 
 
 
495 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  34.13 
 
 
486 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  30.73 
 
 
483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1367  cation transporter  30.47 
 
 
508 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.460237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  31.92 
 
 
482 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1591  cation uptake protein  32.85 
 
 
475 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  30.43 
 
 
477 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  31.1 
 
 
481 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  30.55 
 
 
487 aa  172  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1156  cation transporter  33.33 
 
 
503 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  30.09 
 
 
483 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  30.8 
 
 
483 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  31.4 
 
 
483 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  29.5 
 
 
483 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  30.3 
 
 
488 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2084  cation transporter  28.36 
 
 
485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  29.4 
 
 
485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  28.92 
 
 
510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  32.44 
 
 
478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  30.02 
 
 
509 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  31.59 
 
 
505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  31.89 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0311  Trk-type K+ transport system, membrane component  31.07 
 
 
479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.766234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  30.37 
 
 
483 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  27.65 
 
 
520 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  31.73 
 
 
482 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  30.51 
 
 
514 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  30.83 
 
 
473 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  30.43 
 
 
482 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  29.16 
 
 
480 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  29.98 
 
 
483 aa  160  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  29.33 
 
 
494 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  28.83 
 
 
512 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  29.98 
 
 
498 aa  158  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  30.58 
 
 
480 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  28.72 
 
 
485 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  29.44 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3058  cation transporter  29.27 
 
 
506 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  29.06 
 
 
481 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  29.88 
 
 
483 aa  155  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  30.61 
 
 
485 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  27.1 
 
 
484 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  27.1 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  28.67 
 
 
516 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  26.86 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  30.54 
 
 
486 aa  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  28.23 
 
 
484 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  28.48 
 
 
479 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3914  cation transporter  26.72 
 
 
491 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.847036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  28.84 
 
 
514 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  28.81 
 
 
486 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  30.37 
 
 
485 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  30.14 
 
 
485 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  30.14 
 
 
485 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  28.35 
 
 
480 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  29.06 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  31.04 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  30.14 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  29.67 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  29.67 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  29.67 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  27.92 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  29.22 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  29.67 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  26.62 
 
 
484 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  27.99 
 
 
484 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>