More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3152 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  77.95 
 
 
330 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  77.64 
 
 
330 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  73.87 
 
 
371 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  69.07 
 
 
327 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  79.87 
 
 
331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  74.75 
 
 
325 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  52.35 
 
 
349 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  51.84 
 
 
326 aa  330  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  50.99 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  49.34 
 
 
339 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  47.68 
 
 
337 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  46.64 
 
 
322 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  49.68 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  48.34 
 
 
334 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  48.01 
 
 
339 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  47.45 
 
 
331 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.56 
 
 
327 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.6 
 
 
328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.2 
 
 
345 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.2 
 
 
345 aa  288  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  45.7 
 
 
333 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.64 
 
 
339 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.91 
 
 
336 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.78 
 
 
330 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.21 
 
 
360 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.78 
 
 
330 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.83 
 
 
339 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  45.97 
 
 
325 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.69 
 
 
339 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.45 
 
 
333 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.03 
 
 
328 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.2 
 
 
333 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  42.86 
 
 
332 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.08 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.42 
 
 
335 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.44 
 
 
325 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.18 
 
 
323 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.96 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.96 
 
 
324 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.24 
 
 
336 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  42.62 
 
 
328 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  44.07 
 
 
323 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 
326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.47 
 
 
334 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  42.99 
 
 
342 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.86 
 
 
338 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.33 
 
 
333 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  42.26 
 
 
336 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.01 
 
 
331 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.74 
 
 
326 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 
358 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  44.91 
 
 
330 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.07 
 
 
349 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  41.81 
 
 
326 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.85 
 
 
344 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.61 
 
 
327 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.33 
 
 
355 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  44.88 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.42 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  42.48 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.18 
 
 
331 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  42.67 
 
 
330 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.22 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  41.41 
 
 
330 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.18 
 
 
322 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.95 
 
 
353 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.06 
 
 
344 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
328 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.18 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.52 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.28 
 
 
314 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.81 
 
 
328 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.18 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.81 
 
 
321 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.52 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  38.11 
 
 
332 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.14 
 
 
324 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.8 
 
 
334 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.28 
 
 
335 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.32 
 
 
322 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.24 
 
 
328 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  41.47 
 
 
332 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.14 
 
 
333 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  41.69 
 
 
339 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.24 
 
 
325 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 
332 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.2 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  44.01 
 
 
326 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.29 
 
 
322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.38 
 
 
327 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  40.74 
 
 
331 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  42.62 
 
 
321 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.18 
 
 
331 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  42.14 
 
 
337 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  43.19 
 
 
321 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>