More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07538 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  100 
 
 
1132 aa  2340    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 
842 aa  243  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  32.79 
 
 
715 aa  214  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  32.27 
 
 
972 aa  197  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  30.82 
 
 
1127 aa  187  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  30.93 
 
 
1277 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  30.68 
 
 
1202 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  32.11 
 
 
1045 aa  174  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  30.39 
 
 
1198 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  28.84 
 
 
701 aa  164  7e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.57 
 
 
900 aa  157  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.16 
 
 
1170 aa  151  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  40.56 
 
 
1184 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  50 
 
 
985 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  49.33 
 
 
1112 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 
1073 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
1073 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.37 
 
 
1070 aa  136  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  47.73 
 
 
1359 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  28.31 
 
 
1161 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.55 
 
 
1129 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  31.88 
 
 
1178 aa  135  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  28.61 
 
 
1088 aa  135  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  42.01 
 
 
1250 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.28 
 
 
1134 aa  133  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
1261 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.53 
 
 
1026 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
848 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
1073 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  47.33 
 
 
977 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  41.48 
 
 
959 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.69 
 
 
1088 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  29.22 
 
 
1082 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.95 
 
 
1082 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  33.69 
 
 
1088 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
1073 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  29.52 
 
 
1904 aa  129  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.3 
 
 
1080 aa  129  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
1120 aa  128  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.89 
 
 
1082 aa  128  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  29.32 
 
 
896 aa  128  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  31.32 
 
 
1901 aa  128  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  28.24 
 
 
1698 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  44.19 
 
 
849 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  29.17 
 
 
1073 aa  127  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 
1105 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  33.7 
 
 
872 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
1105 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  33.21 
 
 
666 aa  126  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  26.8 
 
 
956 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
950 aa  125  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  28.69 
 
 
1070 aa  125  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 
1104 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
1108 aa  125  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  42.28 
 
 
1437 aa  125  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
1068 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  30.36 
 
 
1354 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
1055 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.61 
 
 
918 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
1021 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
918 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  28.38 
 
 
1072 aa  123  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  29.19 
 
 
1362 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.22 
 
 
1194 aa  122  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.67 
 
 
914 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 
982 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  41.81 
 
 
707 aa  122  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  28.72 
 
 
918 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  41.01 
 
 
1068 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  28.72 
 
 
918 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  28.72 
 
 
918 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  28.72 
 
 
918 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.12 
 
 
918 aa  121  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  30.13 
 
 
918 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.65 
 
 
1386 aa  121  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.72 
 
 
918 aa  121  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  28.85 
 
 
918 aa  121  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  28.57 
 
 
918 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
1047 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
1068 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  26.9 
 
 
1150 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
876 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  28.1 
 
 
1047 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
1110 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
1090 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.57 
 
 
918 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.37 
 
 
1078 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.76 
 
 
1227 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  41.42 
 
 
1127 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.69 
 
 
1130 aa  118  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  27.89 
 
 
1125 aa  118  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  26.52 
 
 
988 aa  118  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  28.42 
 
 
777 aa  118  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  25.62 
 
 
1023 aa  117  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.67 
 
 
1091 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  40.28 
 
 
1159 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  29.86 
 
 
891 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  42.48 
 
 
1069 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  42.28 
 
 
1071 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>