250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2477 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2477  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 207 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2389  Collagen triple helix repeat  90.82 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  43.88 
 
 		 2851 aa  98.2  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 813 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  48.48 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.17 
 
 		 689 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  53.64 
 
 		 643 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.85 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50 
 
 		 2914 aa  76.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  51.38 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  54.64 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  42.53 
 
 		 1873 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  56.25 
 
 		 842 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  55.56 
 
 		 835 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  47.92 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  54.37 
 
 		 712 aa  72  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  50.47 
 
 		 466 aa  72  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.47 
 
 		 468 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  52.48 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  51.35 
 
 		 542 aa  72  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  49.12 
 
 		 1101 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  57.83 
 
 		 347 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  57.83 
 
 		 347 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  52.38 
 
 		 585 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  53.68 
 
 		 606 aa  71.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  52.48 
 
 		 451 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  55.32 
 
 		 748 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  48.65 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  52.48 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  52.48 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  50.93 
 
 		 835 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  49.53 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  54.46 
 
 		 706 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  48.28 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  44.14 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  52.48 
 
 		 645 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  50.5 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  49.57 
 
 		 442 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  51.58 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  51.92 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  46.15 
 
 		 426 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  51.49 
 
 		 1426 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  46.3 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  45.83 
 
 		 524 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  50.91 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50.91 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  40.54 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  54.67 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  53.93 
 
 		 867 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  52.59 
 
 		 344 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  58.62 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  51.9 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.22 
 
 		 835 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  49.33 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.38 
 
 		 512 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  64.15 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 		 936 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  53.19 
 
 		 434 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  53.68 
 
 		 1168 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  48.51 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  60 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  45.19 
 
 		 462 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  56.9 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  62.5 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  44.79 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.96 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  48.57 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  52.38 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  60.38 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  51.04 
 
 		 1147 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  43.14 
 
 		 647 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  44.34 
 
 		 1219 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  58.49 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  45.79 
 
 		 639 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  56.47 
 
 		 1297 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  44.44 
 
 		 815 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  57.65 
 
 		 934 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  48.6 
 
 		 436 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  49.4 
 
 		 366 aa  62  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  41.23 
 
 		 582 aa  61.6  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  48.81 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  45.38 
 
 		 767 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  49.51 
 
 		 1321 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  45.57 
 
 		 80 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  43.27 
 
 		 1055 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  71.79 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  42.31 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  55.29 
 
 		 951 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  47.57 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  51.14 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  43.9 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  45.76 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  69.05 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  54.17 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.52 
 
 		 838 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  56.67 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  58.49 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 1170 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  70 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>