158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0571 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  62.88 
 
 		 592 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 562 aa  1149    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  81.28 
 
 		 562 aa  952    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  62.22 
 
 		 580 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  98.75 
 
 		 562 aa  1135    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  81.28 
 
 		 562 aa  952    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  99.47 
 
 		 562 aa  1142    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  48.67 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.49 
 
 		 563 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.58 
 
 		 582 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  43.04 
 
 		 574 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.86 
 
 		 581 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  43.19 
 
 		 581 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  43.78 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  42.86 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  42.33 
 
 		 585 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.22 
 
 		 581 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.76 
 
 		 587 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  38.21 
 
 		 561 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  37.17 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  38.25 
 
 		 578 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  38.94 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  35.27 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.74 
 
 		 586 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.52 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.75 
 
 		 595 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  37.43 
 
 		 568 aa  343  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  37.96 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  37.62 
 
 		 585 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  38.3 
 
 		 590 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  37.45 
 
 		 584 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  38.23 
 
 		 590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.68 
 
 		 593 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.28 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  35.79 
 
 		 586 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  36.33 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  35.99 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  35.17 
 
 		 588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.51 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  35.15 
 
 		 574 aa  300  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.17 
 
 		 568 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.94 
 
 		 570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  28.95 
 
 		 566 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  28.85 
 
 		 539 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  66.24 
 
 		 354 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.04 
 
 		 593 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  27.33 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  28.89 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.07 
 
 		 566 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.29 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  31.02 
 
 		 569 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  32.93 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.68 
 
 		 554 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  30.53 
 
 		 565 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  32.69 
 
 		 562 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.95 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  32.45 
 
 		 562 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.04 
 
 		 557 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.08 
 
 		 558 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  30.58 
 
 		 570 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.17 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.57 
 
 		 585 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 		 568 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  38.26 
 
 		 294 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.04 
 
 		 591 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.87 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.7 
 
 		 591 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.38 
 
 		 592 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.61 
 
 		 573 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  24.76 
 
 		 562 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.81 
 
 		 582 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  41.38 
 
 		 180 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.54 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.75 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.89 
 
 		 553 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  26.81 
 
 		 575 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.08 
 
 		 513 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  26.21 
 
 		 554 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  27.81 
 
 		 583 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  27.35 
 
 		 583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.43 
 
 		 558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25.82 
 
 		 558 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.02 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  25.83 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25.82 
 
 		 558 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  26.12 
 
 		 551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.65 
 
 		 575 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  25.73 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.07 
 
 		 608 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  26.9 
 
 		 570 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  25.24 
 
 		 554 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.02 
 
 		 580 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  24.72 
 
 		 602 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.12 
 
 		 597 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  25.7 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 		 559 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.89 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  23.56 
 
 		 547 aa  97.4  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  43.22 
 
 		 118 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  39.32 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>