89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1445 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  99.49 
 
 		 394 aa  778    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  100 
 
 		 394 aa  783    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  67.6 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  61.32 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  32.39 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  34.37 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  31.73 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  29.76 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  32.18 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  31.37 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  31.1 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  31.44 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  31.16 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  31.9 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  31.16 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  31.88 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  30.05 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  29.82 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.45 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.23 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  30.77 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.14 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.77 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  28.33 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  23.38 
 
 		 830 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  25.77 
 
 		 775 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  22.87 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.01 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  25.33 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.87 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 193 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  23.95 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.43 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  24.4 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.33 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.3 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  23.81 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.39 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.9 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  23.23 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.7 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  22.64 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  40.85 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  21.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  22.98 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  22.98 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  22.25 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  22.98 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  22.98 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  22.98 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  22.25 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  38.36 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  24.4 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  20.41 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.9 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  25.4 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.82 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  24.61 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  24.41 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>