63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3047 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  67.06 
 
 		 619 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  100 
 
 		 598 aa  1230    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  64.3 
 
 		 641 aa  824    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  95.15 
 
 		 598 aa  1156    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  49.05 
 
 		 600 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  47.07 
 
 		 586 aa  522  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.09 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  39.23 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.41 
 
 		 608 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  26.21 
 
 		 604 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  24.95 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.22 
 
 		 695 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.9 
 
 		 605 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  23.83 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  21.98 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.4 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.34 
 
 		 647 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  22.66 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  21.79 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  32.58 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 640 aa  57  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  22.66 
 
 		 634 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  31 
 
 		 634 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.1 
 
 		 626 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.43 
 
 		 674 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  20.85 
 
 		 703 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.8 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  35 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.89 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.76 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.25 
 
 		 639 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.34 
 
 		 685 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.83 
 
 		 758 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.64 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  50 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.88 
 
 		 666 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  27.08 
 
 		 276 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  24 
 
 		 608 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.5 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.34 
 
 		 669 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.21 
 
 		 590 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  24.5 
 
 		 681 aa  47.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  48.89 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.77 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  31.52 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  20.49 
 
 		 667 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 875 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  42.86 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  35.94 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.85 
 
 		 603 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.72 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  52.5 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.89 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  25 
 
 		 505 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  24.58 
 
 		 569 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  27.37 
 
 		 513 aa  45.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  24.58 
 
 		 569 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  39.71 
 
 		 584 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  40.35 
 
 		 885 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  25.4 
 
 		 623 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  20.04 
 
 		 659 aa  43.9  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>