132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4522 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  56.51 
 
 
578 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  94.67 
 
 
563 aa  1073    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
582 aa  1184    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  50.86 
 
 
581 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  50.69 
 
 
581 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  51.29 
 
 
574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  50.52 
 
 
570 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  50.28 
 
 
572 aa  541  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  46.09 
 
 
562 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  46.09 
 
 
562 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  45.69 
 
 
562 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  45.69 
 
 
562 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  46.14 
 
 
562 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  45.69 
 
 
580 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  45.3 
 
 
585 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.09 
 
 
592 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  45.88 
 
 
581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  41.07 
 
 
590 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  40.52 
 
 
590 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  39.58 
 
 
584 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  37.02 
 
 
578 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  38.96 
 
 
588 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.29 
 
 
593 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  37.59 
 
 
561 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.89 
 
 
595 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.25 
 
 
594 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.18 
 
 
584 aa  360  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  37 
 
 
585 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  36.82 
 
 
568 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  36.64 
 
 
585 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  36.89 
 
 
586 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  37.43 
 
 
586 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  36.12 
 
 
574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  38.77 
 
 
584 aa  343  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.4 
 
 
586 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.14 
 
 
563 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  35.3 
 
 
564 aa  329  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.03 
 
 
568 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.88 
 
 
556 aa  306  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.69 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  30.38 
 
 
566 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  33.58 
 
 
550 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.71 
 
 
570 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.73 
 
 
593 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  28.38 
 
 
590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  27.95 
 
 
590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  28.83 
 
 
539 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.81 
 
 
566 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.89 
 
 
585 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  31.3 
 
 
569 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  30.19 
 
 
562 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  30.62 
 
 
565 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  30.19 
 
 
562 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  30.24 
 
 
562 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.19 
 
 
549 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.66 
 
 
560 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.43 
 
 
554 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  35.88 
 
 
294 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.83 
 
 
558 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.13 
 
 
554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  27.97 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.98 
 
 
573 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.54 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.2 
 
 
557 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.87 
 
 
591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.87 
 
 
592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.47 
 
 
591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.47 
 
 
591 aa  146  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.77 
 
 
565 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.79 
 
 
610 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  26.92 
 
 
583 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  27.08 
 
 
583 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.92 
 
 
608 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  26.19 
 
 
558 aa  140  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  25.45 
 
 
582 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  25.75 
 
 
554 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  25.48 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  26.72 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  26.72 
 
 
558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  26.72 
 
 
558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  26.72 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  26.72 
 
 
554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.31 
 
 
580 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.87 
 
 
597 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.81 
 
 
575 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  23.37 
 
 
562 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  26.39 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  27.16 
 
 
602 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  39.49 
 
 
180 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  25.31 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.17 
 
 
553 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  22.12 
 
 
553 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.67 
 
 
560 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  37.95 
 
 
354 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  25.33 
 
 
565 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  21.59 
 
 
513 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  42.2 
 
 
118 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.19 
 
 
567 aa  97.1  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.84 
 
 
559 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  42.99 
 
 
121 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>