More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3655 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  57.93 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  60 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  59.31 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  54.86 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  59.03 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  50.69 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  58.02 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  56.94 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  44.97 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.73 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.16 
 
 		 304 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  45.64 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.99 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  38.19 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.91 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  36.81 
 
 		 143 aa  85.9  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.42 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  84.3  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.42 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  39.86 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  35.42 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  37.24 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  39.86 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  39.16 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  36.55 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  36.11 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  34.9 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.55 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  36.84 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.93 
 
 		 320 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  36.18 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  38.16 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.92 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.37 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.73 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.81 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  38.1 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.42 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  37.5 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  36.24 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  32.65 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.24 
 
 		 288 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  34.72 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  35.37 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.46 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  35.37 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  35.37 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  34.03 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.97 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  37.09 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  36.05 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  34.72 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.88 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.5 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  35.37 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  35.37 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.67 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.62 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  35.37 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  32.21 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  35.33 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>