More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0203 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 886 aa  1823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  45.41 
 
 		 881 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  40.52 
 
 		 866 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  37.67 
 
 		 844 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 825 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 825 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 825 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 825 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  34.95 
 
 		 862 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 825 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 825 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 		 872 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  44.32 
 
 		 846 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.09 
 
 		 870 aa  343  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.63 
 
 		 949 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.45 
 
 		 976 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.23 
 
 		 381 aa  108  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 		 449 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 880 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 880 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 880 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 872 aa  95.5  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.7 
 
 		 521 aa  95.1  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 		 862 aa  95.1  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.31 
 
 		 880 aa  94  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  28.01 
 
 		 880 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.64 
 
 		 739 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.64 
 
 		 739 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 877 aa  92.8  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.64 
 
 		 739 aa  92.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  30.9 
 
 		 349 aa  91.3  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.62 
 
 		 576 aa  91.3  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  25.77 
 
 		 356 aa  91.3  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.82 
 
 		 493 aa  89.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25.32 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  23.12 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.91 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  23.59 
 
 		 356 aa  84.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  27.24 
 
 		 358 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1191 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 		 336 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  24.92 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.38 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  21.02 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.47 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  28.22 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.91 
 
 		 320 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 		 452 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  28.08 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  28.22 
 
 		 354 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 		 332 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  25.51 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  26.69 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.39 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.37 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  25.36 
 
 		 657 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  21.79 
 
 		 348 aa  77.4  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 		 408 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 515 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.39 
 
 		 607 aa  76.6  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  24.65 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  26.72 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  28.53 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  28.22 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  28.22 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  28.22 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.12 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  21.73 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  21.73 
 
 		 401 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.62 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.62 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  26.62 
 
 		 360 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  27.76 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  20.9 
 
 		 601 aa  72  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  26.62 
 
 		 360 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  26.62 
 
 		 360 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  26.62 
 
 		 360 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 		 710 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  26.02 
 
 		 408 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  26.69 
 
 		 370 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  23.97 
 
 		 264 aa  70.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  23.36 
 
 		 493 aa  70.1  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 		 567 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  25.51 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.39 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  27.54 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  27.25 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>