180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2583 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  64.57 
 
 
639 aa  839    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  64.57 
 
 
637 aa  823    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  64.57 
 
 
639 aa  829    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  100 
 
 
602 aa  1260    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.97 
 
 
636 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
639 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.81 
 
 
834 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.15 
 
 
605 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.59 
 
 
762 aa  333  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 
636 aa  333  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.1 
 
 
627 aa  331  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 
639 aa  326  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.33 
 
 
609 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.42 
 
 
613 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.76 
 
 
553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.14 
 
 
618 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.89 
 
 
821 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.26 
 
 
779 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.53 
 
 
905 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.78 
 
 
618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.84 
 
 
655 aa  303  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
673 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.71 
 
 
766 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.57 
 
 
526 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 
785 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.08 
 
 
534 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.8 
 
 
795 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  34.2 
 
 
795 aa  297  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.96 
 
 
542 aa  296  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.51 
 
 
673 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.03 
 
 
634 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.36 
 
 
775 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  35.48 
 
 
776 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 
790 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  34.87 
 
 
777 aa  289  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.8 
 
 
736 aa  289  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
613 aa  286  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
858 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.68 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.7 
 
 
760 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.06 
 
 
533 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 
774 aa  283  7.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
549 aa  279  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.68 
 
 
529 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 
772 aa  274  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.68 
 
 
781 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  34 
 
 
765 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.2 
 
 
527 aa  270  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.02 
 
 
779 aa  268  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.7 
 
 
505 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.56 
 
 
812 aa  264  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.9 
 
 
812 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.05 
 
 
534 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.05 
 
 
866 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.15 
 
 
481 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 
543 aa  250  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 
852 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.62 
 
 
683 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.39 
 
 
593 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.28 
 
 
884 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 
546 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.25 
 
 
614 aa  236  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 
888 aa  236  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 
545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 
422 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.16 
 
 
906 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.43 
 
 
857 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 
853 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  29.74 
 
 
896 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.67 
 
 
863 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
584 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.89 
 
 
794 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.19 
 
 
628 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 
525 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.4 
 
 
888 aa  230  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.61 
 
 
688 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
888 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.13 
 
 
868 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  32.15 
 
 
889 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 
910 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.82 
 
 
915 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 
665 aa  227  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 
913 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 
900 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.68 
 
 
913 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.07 
 
 
547 aa  223  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.63 
 
 
447 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.9 
 
 
797 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.2 
 
 
515 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 
896 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.59 
 
 
549 aa  217  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1025  beta-hexosaminidase  29.9 
 
 
879 aa  217  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.9 
 
 
896 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.88 
 
 
504 aa  216  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.62 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.02 
 
 
533 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  26.72 
 
 
883 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.87 
 
 
676 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.94 
 
 
816 aa  213  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.2 
 
 
688 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>