More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000241 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  91.67 
 
 		 204 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.33 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  70.05 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2197  DNA polymerase III, epsilon subunit  65.83 
 
 		 205 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519695  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  67.34 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  60.4 
 
 		 215 aa  256  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.91 
 
 		 208 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.91 
 
 		 208 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.91 
 
 		 208 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  61.69 
 
 		 203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.41 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3773  DNA polymerase III, epsilon subunit  61.73 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  65.7 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  62.11 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  58.12 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  61.58 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  61.05 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.1 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.51 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.85 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  57.73 
 
 		 222 aa  235  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.36 
 
 		 218 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.33 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.33 
 
 		 229 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.33 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.02 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4665  exonuclease, putative  47.47 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.356009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4300  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.46 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0011109  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.5 
 
 		 203 aa  184  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.45 
 
 		 203 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.9 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4924  exonuclease  45.79 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.39 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2125  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.25 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.39 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  44.85 
 
 		 203 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5296  DNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0646344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4643  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.7 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4768  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.7 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.392412  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5458  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.75 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4910  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.75 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0387516  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.75 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4781  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.73 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3729  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.47 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0049  DNA-directed DNA polymerase  47.93 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00111641  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0479  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.03 
 
 		 159 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4160  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.2 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0016  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0016  DNA-directed DNA polymerase  41.41 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.71 
 
 		 565 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0097  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.45 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  36.21 
 
 		 1407 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  38.01 
 
 		 1433 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  39.43 
 
 		 1397 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 		 1426 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  37.79 
 
 		 1436 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  38.74 
 
 		 1367 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  38.74 
 
 		 1367 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.71 
 
 		 595 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  37.57 
 
 		 1438 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  37.72 
 
 		 170 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  37.57 
 
 		 1438 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  42.94 
 
 		 616 aa  111  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  38.73 
 
 		 1444 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.67 
 
 		 921 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.24 
 
 		 769 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  35.09 
 
 		 1402 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.84 
 
 		 1465 aa  107  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.51 
 
 		 610 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  41.77 
 
 		 590 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.64 
 
 		 453 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  36.31 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  41.88 
 
 		 570 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  38.51 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  39.39 
 
 		 1388 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1442 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.54 
 
 		 595 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  39.44 
 
 		 617 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 		 721 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.98 
 
 		 909 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 574 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.44 
 
 		 453 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  35.63 
 
 		 1435 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  38.8 
 
 		 601 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.77 
 
 		 609 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  37.74 
 
 		 1449 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.74 
 
 		 1449 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.75 
 
 		 392 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  36.71 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.77 
 
 		 584 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2155  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.1 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.12 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  41.25 
 
 		 574 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.42 
 
 		 921 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  37.21 
 
 		 584 aa  99.8  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.04 
 
 		 605 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>