203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2497 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  42.42 
 
 		 298 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  42.42 
 
 		 298 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  42.42 
 
 		 298 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 374 aa  81.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  40.57 
 
 		 777 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  40.91 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  42.27 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  42.27 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  42.27 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.32 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  39.81 
 
 		 788 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  59.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  38.68 
 
 		 852 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  36.45 
 
 		 511 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.37 
 
 		 954 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  37.62 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  32.35 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  49.15 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1315  peptidoglycan-binding LysM  37.39 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  47.62 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  55.1 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40.17 
 
 		 516 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  45.45 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.38 
 
 		 334 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  47.27 
 
 		 651 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  44 
 
 		 638 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  48.15 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.24 
 
 		 627 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  38.96 
 
 		 380 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  43.08 
 
 		 440 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  50 
 
 		 465 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  43.75 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0010  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  39.76 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 440 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  43.55 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  40.82 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 1066 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  44.62 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  43.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 590 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  50 
 
 		 405 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 591 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  54.17 
 
 		 390 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  42.86 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  47.06 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0582  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.628153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 162 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 162 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  45.83 
 
 		 456 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  48.94 
 
 		 663 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 1385 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 1086 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 356 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  52.27 
 
 		 568 aa  48.1  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  45 
 
 		 1309 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  45.45 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  38 
 
 		 659 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 		 474 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 503 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  43.86 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 349 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  45.28 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  35.87 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0367  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.379322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 572 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  43.86 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  51.28 
 
 		 994 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  40.79 
 
 		 388 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 352 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  44.83 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>