More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1563 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  60.12 
 
 		 511 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  61.71 
 
 		 506 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  100 
 
 		 507 aa  1040    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  59.88 
 
 		 509 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  60.4 
 
 		 504 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  60.52 
 
 		 503 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  59.39 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  59.39 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  57.54 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  58.22 
 
 		 501 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  59.33 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  58.13 
 
 		 504 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  57.34 
 
 		 504 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  59.64 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  57.74 
 
 		 503 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  56.91 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  59.72 
 
 		 504 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  58.48 
 
 		 523 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  58.85 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  56.8 
 
 		 507 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  58.23 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  58.23 
 
 		 510 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  57.74 
 
 		 504 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  59.04 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  58.02 
 
 		 531 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  54.27 
 
 		 507 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  57.87 
 
 		 545 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  56.91 
 
 		 503 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  57.17 
 
 		 506 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  58.33 
 
 		 504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  57.17 
 
 		 506 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  54.71 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  56.11 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  55.29 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  58.43 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  57.34 
 
 		 504 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  57.63 
 
 		 515 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  56.94 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  55.03 
 
 		 509 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  55.71 
 
 		 506 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  59.41 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  58.17 
 
 		 523 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  57.14 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  57.14 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  56.94 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  56.75 
 
 		 504 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  57 
 
 		 519 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  58.27 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  58.07 
 
 		 531 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  57.87 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  56.83 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  56.4 
 
 		 530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  57.43 
 
 		 507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  54.72 
 
 		 506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  53.71 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  57.23 
 
 		 511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  58.84 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  53.91 
 
 		 527 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  57.68 
 
 		 536 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  56.71 
 
 		 519 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  57.87 
 
 		 531 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  57.87 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  57.87 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  57 
 
 		 512 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  54.78 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  54.19 
 
 		 565 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  53.53 
 
 		 511 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  53.73 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  54.13 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  59.4 
 
 		 515 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  57.79 
 
 		 547 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0696  threonine dehydratase, biosynthetic  60.2 
 
 		 507 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  57.43 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  58.72 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  56.71 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  53.66 
 
 		 507 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  57.83 
 
 		 516 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  54.97 
 
 		 522 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  55.77 
 
 		 510 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  55.42 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  55.38 
 
 		 506 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  54.49 
 
 		 526 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  54.98 
 
 		 506 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  56.91 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  52.99 
 
 		 529 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  53.95 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  53.07 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  56.91 
 
 		 550 aa  548  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  55.05 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  56.11 
 
 		 503 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  53.18 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  53.91 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  54.51 
 
 		 514 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  57 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  51.95 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  52.67 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  52.87 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  54.71 
 
 		 514 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  55.62 
 
 		 514 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  55.62 
 
 		 514 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>