More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1713 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  92.11 
 
 		 317 aa  599  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  42.19 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  42.01 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  42.07 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  40.15 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  38.87 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  36.26 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  37.59 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  37.6 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  36.58 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  35.63 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  38.25 
 
 		 344 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.58 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.16 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  36.42 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  34.59 
 
 		 512 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 483 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  29.25 
 
 		 541 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 477 aa  95.9  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  31.55 
 
 		 510 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  31.35 
 
 		 541 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  32 
 
 		 541 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  30.77 
 
 		 563 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  28.06 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.02 
 
 		 473 aa  92.4  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  33.15 
 
 		 547 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  34.13 
 
 		 469 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  33.12 
 
 		 548 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  25.69 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.66 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  26.76 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  26.05 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  25 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  27.75 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  26.76 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  28.23 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  27.56 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  25.35 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  25.83 
 
 		 558 aa  79.7  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  27.88 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  26.25 
 
 		 557 aa  79  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  27.22 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  28.3 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  31.11 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  27.2 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  31.55 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  29.3 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.22 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  29.36 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  24.41 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.797828  normal  0.0143577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.11 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  29.27 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  25.96 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  27.83 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.86 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  25.31 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  29.7 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  29.7 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  24.04 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  29.46 
 
 		 598 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.25 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  26.79 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  27.27 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.36 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  27.2 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.46 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.01 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  25.99 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  31 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  26.79 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  29.63 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  25 
 
 		 553 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  27.54 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  26.39 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>