134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0824 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1137    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  49.35 
 
 
556 aa  532  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  49.82 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  49.82 
 
 
556 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  31.24 
 
 
862 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  37.21 
 
 
850 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  32.88 
 
 
877 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  32.88 
 
 
877 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  32.68 
 
 
883 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  36.26 
 
 
896 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  37.19 
 
 
346 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  39.27 
 
 
866 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  30.71 
 
 
881 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  29.07 
 
 
870 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  37.68 
 
 
864 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  27.96 
 
 
875 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  38.08 
 
 
844 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  39.68 
 
 
855 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  37.79 
 
 
844 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.25 
 
 
859 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.25 
 
 
859 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  32.69 
 
 
840 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  39.72 
 
 
875 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  33.09 
 
 
850 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  31.35 
 
 
871 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.69 
 
 
813 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  27.87 
 
 
861 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  31.35 
 
 
871 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.68 
 
 
861 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  27.68 
 
 
861 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  27.68 
 
 
861 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.68 
 
 
861 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  33.52 
 
 
879 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  27.68 
 
 
861 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  27.68 
 
 
861 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  28.06 
 
 
861 aa  203  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  31.83 
 
 
864 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  36.9 
 
 
872 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  37.37 
 
 
880 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  37.37 
 
 
880 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  36.51 
 
 
869 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  35.56 
 
 
867 aa  200  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  34.04 
 
 
867 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  35.04 
 
 
429 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  35.11 
 
 
850 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  30.77 
 
 
863 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  32.09 
 
 
864 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  33.65 
 
 
850 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  38.16 
 
 
880 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  36.48 
 
 
854 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  34.8 
 
 
850 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  33.33 
 
 
850 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  34.8 
 
 
850 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  26.74 
 
 
858 aa  194  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  34.17 
 
 
850 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.89 
 
 
863 aa  192  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  38.95 
 
 
880 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  36.19 
 
 
880 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  37.89 
 
 
880 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  37.83 
 
 
880 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  38.54 
 
 
881 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  33.9 
 
 
854 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  33.55 
 
 
850 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  38.6 
 
 
880 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  31.4 
 
 
889 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  31.4 
 
 
889 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  31.4 
 
 
889 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  27.96 
 
 
861 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  31.07 
 
 
864 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  33.87 
 
 
557 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  30.13 
 
 
840 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  30.13 
 
 
840 aa  186  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  27.12 
 
 
844 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  37.9 
 
 
881 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  31.6 
 
 
864 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  36.51 
 
 
864 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  36.51 
 
 
864 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 
1118 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  24.64 
 
 
569 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  34.24 
 
 
872 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
1132 aa  183  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  30.4 
 
 
877 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  32.05 
 
 
395 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  28.82 
 
 
847 aa  169  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  28.74 
 
 
851 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  38.41 
 
 
876 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  29.06 
 
 
851 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  30.15 
 
 
851 aa  163  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  27.73 
 
 
861 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  31.46 
 
 
590 aa  157  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  28.84 
 
 
839 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  26.06 
 
 
701 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  26.52 
 
 
592 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  26.46 
 
 
850 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  27.41 
 
 
656 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  26.15 
 
 
643 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  28.14 
 
 
905 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  28.68 
 
 
599 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  24.76 
 
 
723 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  25.97 
 
 
877 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>