More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  69.85 
 
 		 148 aa  199  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  54.41 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  56.3 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  55.71 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  48.53 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  54.68 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  49.28 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  48.44 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  51.88 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  45.32 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  46.61 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  39.46 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  36.44 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  37.4 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>