More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1226 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 324 aa  665    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  79.63 
 
 		 324 aa  556  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  54.34 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  53.4 
 
 		 332 aa  329  3e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  52.75 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  53.07 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  53.07 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  50.48 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  49.06 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  50 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  48.12 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  46.84 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  46.86 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  49.07 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  44.25 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  45.43 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  44.74 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  42.86 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  43.27 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  43.84 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  45.34 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  44.03 
 
 		 322 aa  278  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  43.71 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  43.4 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  43.71 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  45.86 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  43.08 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  44.79 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  40.82 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  42.86 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  40.51 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  39.1 
 
 		 343 aa  225  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  39.62 
 
 		 658 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  39.38 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  39.57 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  37 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  41.67 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  29.85 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  31.07 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  33.33 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  30.28 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  33 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  36.97 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  34.47 
 
 		 224 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  32.79 
 
 		 235 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  35.83 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  34.51 
 
 		 227 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  33.61 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  34.18 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  31.4 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  32.22 
 
 		 243 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  30.74 
 
 		 225 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.39 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  30.64 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  29.33 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  34.65 
 
 		 554 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  29.75 
 
 		 226 aa  90.1  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.44 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  34.32 
 
 		 217 aa  85.9  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  30.52 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  31.47 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  27.44 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  27.87 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  28.91 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  28.91 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  30.56 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  26.89 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  26.81 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  28.11 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  25.64 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  27.23 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  28.77 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86836  predicted protein  27.08 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  26.76 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2185  recombinase A  28.44 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019841  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  27.14 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  27.57 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  29.39 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  28.24 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  27.19 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  28.07 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  27.8 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  28.38 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  28.91 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  29.44 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  26.76 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  27.85 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  27.01 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  27.88 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0206  recA protein  26.44 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.613588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  27.96 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  26.89 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  26.19 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  27.57 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  27.57 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  27.69 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  28.7 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  27.01 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>