More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4702 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 277 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  25.93 
 
 		 234 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  26.2 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  27.07 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.52 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  27.36 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  24.66 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>