109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2696 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  46.49 
 
 
833 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  100 
 
 
822 aa  1717    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  51.54 
 
 
843 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  33.89 
 
 
778 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  33.72 
 
 
789 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  33.41 
 
 
788 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  33.76 
 
 
788 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  33.68 
 
 
789 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  38.42 
 
 
725 aa  235  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  39.47 
 
 
738 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  28.55 
 
 
724 aa  230  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  36.84 
 
 
745 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  37.73 
 
 
741 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  37.17 
 
 
729 aa  223  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  27.12 
 
 
727 aa  222  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  37.7 
 
 
722 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  37.6 
 
 
719 aa  207  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  37.63 
 
 
720 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  37.22 
 
 
731 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  36.65 
 
 
724 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  35.33 
 
 
735 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  36.36 
 
 
730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  36.36 
 
 
730 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  36.36 
 
 
730 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  35.8 
 
 
731 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.59 
 
 
826 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  30.08 
 
 
745 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  23.68 
 
 
757 aa  144  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.96 
 
 
639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.59 
 
 
639 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.67 
 
 
639 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  25.06 
 
 
639 aa  137  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.67 
 
 
639 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  26.15 
 
 
639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  28.82 
 
 
716 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  25.54 
 
 
640 aa  127  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  26.03 
 
 
761 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.58 
 
 
639 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.95 
 
 
764 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  25.92 
 
 
761 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  25.92 
 
 
764 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  25.81 
 
 
764 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  26.45 
 
 
646 aa  125  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.67 
 
 
639 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  25.67 
 
 
755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  28.36 
 
 
729 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.53 
 
 
754 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  26.13 
 
 
758 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  23.43 
 
 
820 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  29.8 
 
 
782 aa  104  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 
766 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.92 
 
 
714 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  23.83 
 
 
764 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  24.25 
 
 
898 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.31 
 
 
898 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  21.61 
 
 
650 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.46 
 
 
671 aa  89  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  24.81 
 
 
898 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  29 
 
 
741 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  21.64 
 
 
650 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  29.45 
 
 
639 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  29.45 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  31.47 
 
 
742 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  29.43 
 
 
765 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.79 
 
 
885 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  20.32 
 
 
650 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  30.61 
 
 
742 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  31.03 
 
 
809 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  20.44 
 
 
650 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  31.8 
 
 
657 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  29.93 
 
 
770 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  20.32 
 
 
650 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  20.32 
 
 
650 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  30.46 
 
 
742 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.74 
 
 
893 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  21.97 
 
 
663 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  33.33 
 
 
762 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  33.33 
 
 
762 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  21.36 
 
 
656 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  29.11 
 
 
677 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  30.8 
 
 
762 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  22.24 
 
 
656 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.55 
 
 
945 aa  68.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.04 
 
 
731 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  21.35 
 
 
655 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  24.7 
 
 
895 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  31.35 
 
 
680 aa  64.3  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  24.18 
 
 
653 aa  64.3  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  30.11 
 
 
700 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  29.11 
 
 
762 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  29.56 
 
 
655 aa  62  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  29.9 
 
 
642 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  26.55 
 
 
1111 aa  61.2  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  30.77 
 
 
696 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  30.77 
 
 
696 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  31.28 
 
 
612 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  29.32 
 
 
785 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 
667 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  21.44 
 
 
936 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  30.77 
 
 
698 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>