272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2989 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  61.98 
 
 		 192 aa  263  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  60.32 
 
 		 194 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  61.83 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 202 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  52.43 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  51.34 
 
 		 203 aa  204  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  51.32 
 
 		 203 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  48.6 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  47.87 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  52.17 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  52.54 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 203 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  39.57 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  30.27 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  30.65 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  28.72 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  23.65 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  24.75 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  28.71 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  36.49 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  25.77 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 239 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  24.14 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.16 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.63 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  33.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.63 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  24.43 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  39.44 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  37.68 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.93 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.82 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.17 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0917  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07021  isochorismatase hydrolase family protein  31.43 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  29.07 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  25.4 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  40.58 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  30 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  32.1 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  30.68 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.82 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>