More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0097 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
494 aa  987    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  50.6 
 
 
493 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  50.51 
 
 
493 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  49.4 
 
 
493 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  47.87 
 
 
492 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  44.66 
 
 
503 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  44.13 
 
 
490 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  45.8 
 
 
489 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  47.67 
 
 
489 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  44.47 
 
 
503 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  46.87 
 
 
489 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  44.27 
 
 
503 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  44.47 
 
 
516 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  44.18 
 
 
521 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  44.18 
 
 
519 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  44.18 
 
 
495 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  45.89 
 
 
491 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  44.78 
 
 
495 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  44.13 
 
 
497 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  48.79 
 
 
499 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  42.19 
 
 
512 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  41.84 
 
 
512 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  41.84 
 
 
512 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  38.49 
 
 
503 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  39.47 
 
 
503 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 
503 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 
503 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  38.08 
 
 
506 aa  320  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  39.63 
 
 
502 aa  319  9e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  38.55 
 
 
504 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  38.32 
 
 
503 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  38.51 
 
 
552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  36.57 
 
 
495 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  36.22 
 
 
553 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.59 
 
 
550 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  37.6 
 
 
498 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  35.67 
 
 
488 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  38.43 
 
 
492 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  36.9 
 
 
509 aa  286  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  35.26 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  35.16 
 
 
504 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  38.14 
 
 
496 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  35.13 
 
 
488 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  38.43 
 
 
496 aa  279  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  37.02 
 
 
665 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  34.34 
 
 
488 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  36.34 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  34.62 
 
 
504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  34.62 
 
 
504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.34 
 
 
492 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  34.28 
 
 
503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  36.77 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  36.09 
 
 
491 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  35.67 
 
 
507 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  34.01 
 
 
499 aa  269  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  35.69 
 
 
545 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 
515 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  37.83 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  36.5 
 
 
537 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  33.94 
 
 
503 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  38.02 
 
 
496 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  35.91 
 
 
495 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  34.88 
 
 
510 aa  253  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  35.62 
 
 
512 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  35.33 
 
 
512 aa  247  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  33.4 
 
 
517 aa  240  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  38.74 
 
 
499 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  38.74 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  33.27 
 
 
517 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  38.54 
 
 
499 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  34.76 
 
 
540 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  37.7 
 
 
500 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  32.27 
 
 
501 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  31.01 
 
 
492 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  27.71 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  37.28 
 
 
471 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  24.12 
 
 
545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  36.87 
 
 
548 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  33.5 
 
 
832 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.63 
 
 
732 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  28.54 
 
 
509 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  28.54 
 
 
509 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.67 
 
 
718 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  37.3 
 
 
804 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.7 
 
 
784 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 
753 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  36.31 
 
 
829 aa  114  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  31.78 
 
 
1284 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  33.67 
 
 
739 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.57 
 
 
781 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  37.91 
 
 
732 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  33.48 
 
 
756 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.37 
 
 
800 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.14 
 
 
768 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.6 
 
 
718 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  30.74 
 
 
599 aa  111  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.26 
 
 
703 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  34.92 
 
 
729 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  37.22 
 
 
776 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.21 
 
 
760 aa  111  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>