More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3975 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  100 
 
 		 337 aa  702    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  79.28 
 
 		 333 aa  558  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  51.94 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  47.53 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 343 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  34.23 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  32.15 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  38 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 347 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  37.04 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  40.61 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  35.2 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  38.08 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  34.17 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.47 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.27 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  32 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  34.53 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 387 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  39.13 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  38.79 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  38.5 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  35.24 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.01 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.73 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  35.54 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  35.54 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  34.96 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.04 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.7 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  33.19 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  35.38 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>