More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2031 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  100 
 
 		 413 aa  830    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  37.59 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  37.37 
 
 		 470 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 480 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  38.67 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  37.57 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  37.82 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  37.82 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  37.82 
 
 		 480 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  38.83 
 
 		 507 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  36.09 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  34.95 
 
 		 491 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  33.63 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  33.43 
 
 		 461 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  30.4 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  30.4 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  31 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.55 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.78 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.36 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  32.39 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  31.58 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  27 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  28.35 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.45 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 		 647 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  29.32 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  29.62 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.91 
 
 		 416 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  29.88 
 
 		 435 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  29.7 
 
 		 429 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  27.98 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 429 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  29.88 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  29.88 
 
 		 435 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30.11 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  28.32 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  29.05 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  29.74 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  27.3 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  29.83 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  26.13 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  26.92 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  29.19 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  27.06 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  28.13 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.2 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  29.34 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  30.67 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  28.92 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  27.22 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  26.48 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  27.61 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  27.04 
 
 		 356 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  24.8 
 
 		 414 aa  96.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  29.84 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 		 476 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.92 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  28.09 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  25.85 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  28.29 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  27.87 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.2 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.37 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.37 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>