82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2002 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  50.52 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  50 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  50 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  50 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  50.27 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  50 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  48.5 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  44.83 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  46.35 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  48.7 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  50.87 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  49.43 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  45.27 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  42.39 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  42.5 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  48.62 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  40.22 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  38.69 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  39.38 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  38.33 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  37.57 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  38.12 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  37.99 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  33.87 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  35.75 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  35.87 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  35.16 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  35.33 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  36.75 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  35.34 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  32.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  38.89 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  35.16 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  28.28 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.34 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.34 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  28.57 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  33.33 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.78 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  31.62 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  32.32 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.32 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.32 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  34.07 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.32 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  37.08 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  33.59 
 
 		 521 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  32.97 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  33.93 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  32.03 
 
 		 556 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  31.58 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  29.22 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  28.77 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  34.82 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  34.19 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  32.63 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  31.31 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  28.19 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.73 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  30.7 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  33.66 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  38 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  37.37 
 
 		 377 aa  45.1  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  33.33 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  36.78 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  29.5 
 
 		 384 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  34.41 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  28.97 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  28.08 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  30.08 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  32.93 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  28.97 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  32.11 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  29.77 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  29.55 
 
 		 229 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.87 
 
 		 238 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  29.51 
 
 		 273 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  32.41 
 
 		 305 aa  41.6  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>