170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1199 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 438 aa  862    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  66.59 
 
 		 452 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  66.82 
 
 		 452 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  67.05 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.5 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  58.31 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  57.88 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  52.69 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  50.11 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  49.77 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  49.77 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  49.31 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  49.54 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  49.54 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  49.31 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  50.45 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  48.5 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  49.08 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  49.54 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  49.54 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  49.54 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  47.6 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  50.83 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  46.8 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  45.25 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  46.31 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  44.14 
 
 		 429 aa  349  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  44.63 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  44.06 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  40.67 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  42.98 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  44.34 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  43.55 
 
 		 429 aa  308  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  44.94 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  39.55 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  43.87 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  41.16 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  40.77 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.53 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  37.32 
 
 		 1140 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  34.32 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  30.84 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.08 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.43 
 
 		 417 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  37.8 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.57 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.08 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  31.7 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  34.11 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  32.73 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  34.2 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.37 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.3 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.46 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.79 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  35.58 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.49 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  33.81 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  34.21 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  33.71 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  32.11 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  34.31 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  32.87 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.28 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.07 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.16 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  30.86 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.22 
 
 		 410 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  35.21 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  35.21 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  32.62 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  35.55 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  32.16 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.39 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.39 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.39 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.39 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.06 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  34.44 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  28.77 
 
 		 412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  34.51 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.45 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  31.97 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  31.54 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.96 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  34.22 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  29.56 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  30.89 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  34.28 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  30.87 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  31.37 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.63 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  27.21 
 
 		 430 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  31.84 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  31.46 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  30.09 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  27.96 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>