104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1540 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  100 
 
 		 456 aa  936    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  36.9 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1310  hypothetical protein  24.81 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00248833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  25.86 
 
 		 403 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  22.83 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  26.08 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  26.4 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  23.24 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  25.68 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  23.4 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  26 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  26.6 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  23.28 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  23.28 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  24.49 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  31.29 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  23.47 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  25.68 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  25.68 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  31.25 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  26.94 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  24.93 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  28.74 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  24.72 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  21.83 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  25.95 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  30.05 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  29.95 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0114  hypothetical protein  22.77 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1951  hypothetical protein  25.09 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2309  hypothetical protein  25.09 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0988635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  27.98 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  25.81 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  25.81 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  25.14 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  27.5 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  25.27 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  25.71 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  27.04 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  39.68 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  26.32 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  27.17 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  27.59 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  28.7 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  26.63 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  27.64 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  29.69 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  36.21 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  26.84 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  23.68 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  23.87 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  25.26 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  23.12 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  22.67 
 
 		 398 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  26.46 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  26.58 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  37.04 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  24.86 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  25.14 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  28.35 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  32.35 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  23.38 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  27.07 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  23.28 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  27.56 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  25.41 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  39.66 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  26.8 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  28.28 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  24.44 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  39.66 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  26.62 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  25.13 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  39.66 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  26.62 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  26.44 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  37.93 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  25.16 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  27.12 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  25.56 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  25.93 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  22.95 
 
 		 456 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  24.61 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  23.68 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  23.16 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  26.34 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  24.17 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  25.32 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  24.45 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  29.66 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  25.61 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  23.89 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  24.38 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  32.86 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  26.88 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  23.74 
 
 		 418 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  35.29 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  25 
 
 		 416 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  26.09 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  23.03 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>