More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0130 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  75.31 
 
 		 869 aa  1270    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  100 
 
 		 935 aa  1904    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  57.75 
 
 		 951 aa  1031    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  54.35 
 
 		 938 aa  951    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  58.77 
 
 		 938 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  83.97 
 
 		 936 aa  1560    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  74.11 
 
 		 871 aa  1217    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  56.9 
 
 		 865 aa  940    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  73.99 
 
 		 871 aa  1217    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  58.85 
 
 		 951 aa  1023    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  81.11 
 
 		 856 aa  1382    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  74.11 
 
 		 867 aa  1246    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  74.42 
 
 		 865 aa  1250    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  84.4 
 
 		 936 aa  1567    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  57.03 
 
 		 965 aa  1013    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  56.14 
 
 		 945 aa  1019    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  37.15 
 
 		 918 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  34.42 
 
 		 751 aa  396  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.91 
 
 		 795 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.3 
 
 		 796 aa  366  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.91 
 
 		 796 aa  364  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.04 
 
 		 796 aa  363  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  32.69 
 
 		 795 aa  363  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.91 
 
 		 795 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.56 
 
 		 795 aa  362  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.56 
 
 		 795 aa  362  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.56 
 
 		 795 aa  362  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.56 
 
 		 795 aa  362  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  32.14 
 
 		 794 aa  361  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  32.39 
 
 		 794 aa  360  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  32.09 
 
 		 812 aa  361  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.17 
 
 		 795 aa  360  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  31.52 
 
 		 795 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  31.78 
 
 		 795 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  31.1 
 
 		 799 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  30.77 
 
 		 799 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  31.19 
 
 		 799 aa  346  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  30.51 
 
 		 799 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  30.6 
 
 		 796 aa  343  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  30.38 
 
 		 799 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  30.38 
 
 		 799 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  30.38 
 
 		 799 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  30.38 
 
 		 799 aa  340  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  30.38 
 
 		 799 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  31.62 
 
 		 795 aa  336  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  30.08 
 
 		 770 aa  224  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  30.54 
 
 		 763 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  30.24 
 
 		 763 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  30.43 
 
 		 764 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.23 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.92 
 
 		 927 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  31.08 
 
 		 746 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  27.39 
 
 		 781 aa  191  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  27.7 
 
 		 771 aa  191  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.55 
 
 		 1045 aa  189  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  29.09 
 
 		 760 aa  187  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  24.96 
 
 		 924 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  25.84 
 
 		 768 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  26.43 
 
 		 811 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.13 
 
 		 747 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  27.92 
 
 		 806 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  25.47 
 
 		 825 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  47.27 
 
 		 918 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  50.35 
 
 		 1150 aa  104  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  41.86 
 
 		 1916 aa  99.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  48.23 
 
 		 1565 aa  95.1  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  39.88 
 
 		 816 aa  94.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  29.19 
 
 		 566 aa  90.5  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  43.45 
 
 		 2066 aa  89  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  42.76 
 
 		 2272 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  42.76 
 
 		 3295 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  39.1 
 
 		 1027 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35.41 
 
 		 792 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.33 
 
 		 910 aa  85.5  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.89 
 
 		 1842 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  46.04 
 
 		 1667 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.2 
 
 		 1667 aa  84.7  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.77 
 
 		 1682 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  39.73 
 
 		 1120 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  41.94 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  35.91 
 
 		 1236 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  44.17 
 
 		 1095 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  40.67 
 
 		 3197 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  37.86 
 
 		 859 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  36.43 
 
 		 873 aa  82.4  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  34.58 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.14 
 
 		 2036 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.14 
 
 		 1241 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.23 
 
 		 1732 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  34.87 
 
 		 940 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.67 
 
 		 1969 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40.13 
 
 		 1057 aa  81.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  44.92 
 
 		 1231 aa  81.6  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  40 
 
 		 3197 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.58 
 
 		 615 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  44.96 
 
 		 963 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.43 
 
 		 675 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  35.43 
 
 		 2000 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  39.33 
 
 		 791 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.29 
 
 		 869 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>