277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0118 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 		 207 aa  387  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  47.18 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  47.12 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  41.84 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.01 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.5 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  41.35 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.88 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  41.36 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.36 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  44.5 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.5 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  41.9 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  40.32 
 
 		 455 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.02 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.6 
 
 		 539 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.12 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  48.82 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  41.05 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.82 
 
 		 533 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.78 
 
 		 533 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  39.49 
 
 		 534 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  28.8 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.7 
 
 		 534 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  39.69 
 
 		 534 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  42.33 
 
 		 538 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  41.58 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  37.24 
 
 		 534 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  40.61 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.63 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.42 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.87 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  41.95 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  36.27 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  39.79 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  38.54 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.9 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.78 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  41.44 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  39.15 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.84 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.23 
 
 		 575 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  30.93 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  36.05 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.02 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.13 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  25 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.55 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  40.21 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  38.66 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  35.03 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  35.08 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.09 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  36.6 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  38.34 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.22 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  39.46 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  37.24 
 
 		 539 aa  78.2  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.25 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.18 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.23 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  28.93 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.32 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  35.32 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  38.05 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  27.62 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  35.82 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  32.39 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.1 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 544 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  39.08 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  24.88 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.92 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  41.24 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  41.24 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  34.34 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  34.34 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  31.72 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1564  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthase  39.8 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25.52 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  36.96 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.01 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  37.08 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 591 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  33 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  40.72 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  33.16 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  31.96 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.76 
 
 		 538 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  34.69 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  36.7 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.02 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  26.02 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  32.63 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25.26 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>