More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3589 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  54.19 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  52.97 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  48.21 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  39.72 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  37.77 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.75 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  33.49 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  36.65 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  40.86 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  36.7 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  36.13 
 
 		 240 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 255 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 262 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 262 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>