More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2203 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2203  HflK  100 
 
 		 407 aa  810    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  50.13 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  51.56 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  53.26 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  51.41 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  50.85 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  51.69 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  52.34 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  52.34 
 
 		 379 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  49.14 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  49.09 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  45.03 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  49.06 
 
 		 361 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  46.84 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  45.82 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  46.97 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  46.07 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  48.99 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  48.37 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  41.09 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  40.21 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  44.71 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.04 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  44.02 
 
 		 389 aa  273  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  44.55 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  43.1 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  43.81 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  38.78 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  41.55 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  46.59 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  47.74 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  46.59 
 
 		 382 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  43.5 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  46.15 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  40.91 
 
 		 344 aa  259  8e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  39.9 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  41.54 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  39.17 
 
 		 357 aa  256  7e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  38.4 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  39.33 
 
 		 355 aa  253  6e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  40.26 
 
 		 413 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  42.09 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  43.29 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.42 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  38.48 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  39.02 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  39.01 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  38.92 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  38.92 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  39.01 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  40.29 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  46.18 
 
 		 347 aa  243  5e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  38.2 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.02 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.86 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  41.78 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.13 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  33.65 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  38.1 
 
 		 383 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  40.68 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  37.57 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  40.68 
 
 		 308 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.96 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.94 
 
 		 464 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  36.88 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  36.13 
 
 		 389 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  36.88 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.45 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.21 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  36.61 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.87 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  39.35 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  40 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.32 
 
 		 447 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  34.22 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.87 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  41.82 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  34.67 
 
 		 503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  40.59 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  36.16 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  38.93 
 
 		 322 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  36.29 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  36.29 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  34.12 
 
 		 498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  35.06 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  36.22 
 
 		 414 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  35.32 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  35.68 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.68 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.03 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.13 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  37.46 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  38.3 
 
 		 370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  37.85 
 
 		 457 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  34.58 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  33.99 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.25 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.46 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.76 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.76 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>