More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0111 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 317 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  96.21 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  80.06 
 
 		 319 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  63.11 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  61.17 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.72 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  55.35 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  54.61 
 
 		 306 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  50.32 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  53.57 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  49.68 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  52.15 
 
 		 317 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  53.25 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  49.83 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  48.18 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  48.54 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  49.15 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  47.57 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  45.31 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  42.53 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.98 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  29.72 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.49 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  28.77 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  32.81 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.34 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  32.48 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  27.66 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.49 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.91 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.26 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.68 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.01 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  26.19 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.22 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  30.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  27.96 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  30.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  29.38 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.46 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>