86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3943 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  93.01 
 
 		 429 aa  825    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 429 aa  893    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  66.19 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  60.61 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  55.28 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  50.35 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  44.83 
 
 		 441 aa  352  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  40.96 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  41.83 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  36.89 
 
 		 538 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  32.97 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  32.01 
 
 		 479 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  32.79 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  30.35 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  30.64 
 
 		 408 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  32.35 
 
 		 627 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  31.84 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  34.91 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  29.58 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  31.5 
 
 		 711 aa  186  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  30.3 
 
 		 596 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  34.46 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  28.61 
 
 		 479 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  32.49 
 
 		 485 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  32.3 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  29.63 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  30.52 
 
 		 479 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  30.57 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  29.41 
 
 		 731 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  28.46 
 
 		 474 aa  163  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  32.56 
 
 		 674 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  30.56 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  31.5 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  31.17 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  32.71 
 
 		 474 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  28.46 
 
 		 482 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.59 
 
 		 644 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.48 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  27.43 
 
 		 492 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.43 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  29.4 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  25.66 
 
 		 473 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  29.61 
 
 		 490 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  26.41 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.97 
 
 		 698 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  25.97 
 
 		 532 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  26.21 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  25.71 
 
 		 464 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  31.65 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  28.2 
 
 		 690 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  23.89 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.71 
 
 		 688 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 		 638 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  24.42 
 
 		 932 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  27.09 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 		 798 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  27.54 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  23.84 
 
 		 750 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  23.78 
 
 		 534 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  24.17 
 
 		 515 aa  97.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.87 
 
 		 709 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  21.6 
 
 		 537 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  30.3 
 
 		 704 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  27.7 
 
 		 581 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.59 
 
 		 687 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 		 434 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  22.92 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  28.06 
 
 		 606 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.6 
 
 		 704 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  33.08 
 
 		 495 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.08 
 
 		 487 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  23.94 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  23.25 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  22.83 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  24.12 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  32.31 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  33.82 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  31.54 
 
 		 584 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  31.58 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  24.91 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  24.32 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  21.67 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  18.69 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  18.69 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>