114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1672 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  100 
 
 
894 aa  1728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  65.31 
 
 
894 aa  732    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  36.77 
 
 
1424 aa  296  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  37.29 
 
 
1428 aa  277  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  35.15 
 
 
1057 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  34.36 
 
 
1053 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  30.78 
 
 
1073 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  31.03 
 
 
618 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  32.23 
 
 
1034 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  29.37 
 
 
1157 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  29.44 
 
 
617 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  29.49 
 
 
1167 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.45 
 
 
1118 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.58 
 
 
2194 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.96 
 
 
1113 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.61 
 
 
1340 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 
1222 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  43.4 
 
 
2310 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.51 
 
 
889 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 
1225 aa  74.3  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.06 
 
 
2305 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 
1012 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.39 
 
 
928 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.97 
 
 
1037 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  47.2 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.78 
 
 
891 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.31 
 
 
1004 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  26.99 
 
 
443 aa  61.2  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.78 
 
 
1009 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.9 
 
 
768 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  41.11 
 
 
346 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  41.94 
 
 
354 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.56 
 
 
1180 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.94 
 
 
1269 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.72 
 
 
1661 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.94 
 
 
1269 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  25.53 
 
 
738 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.91 
 
 
16311 aa  55.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  25.15 
 
 
447 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  54.35 
 
 
830 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.33 
 
 
1800 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  31.91 
 
 
529 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1295  FHA domain containing protein  39.29 
 
 
295 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  44 
 
 
156 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3468  FHA domain containing protein  42.47 
 
 
544 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.371082  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  36.84 
 
 
513 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1396  FHA domain containing protein  39.29 
 
 
295 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0424  FHA domain-containing protein  27.92 
 
 
377 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.56 
 
 
647 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  45.1 
 
 
242 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
1083 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  45.26 
 
 
916 aa  51.2  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  25 
 
 
446 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  39.66 
 
 
518 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1396  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.84 
 
 
441 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  43.04 
 
 
159 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
152 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  33.66 
 
 
238 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  24.66 
 
 
476 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  45.65 
 
 
241 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  32.47 
 
 
279 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  39.24 
 
 
402 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  59.46 
 
 
1159 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.37 
 
 
1394 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  46.84 
 
 
161 aa  49.3  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
167 aa  48.9  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2541  FHA domain-containing protein  35.21 
 
 
514 aa  48.5  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.913197  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  45.33 
 
 
121 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  36.84 
 
 
456 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  48.1  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  53.26 
 
 
793 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  24.88 
 
 
490 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4616  FHA domain containing protein  41.79 
 
 
328 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  48.11 
 
 
2353 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  46 
 
 
174 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  36.73 
 
 
141 aa  47.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.48 
 
 
615 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  42.47 
 
 
154 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  50 
 
 
307 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6874  FHA domain containing protein  41.1 
 
 
512 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  44 
 
 
121 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  42.65 
 
 
234 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  26.67 
 
 
518 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  44 
 
 
121 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0025  FHA domain containing protein  40 
 
 
160 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  28.42 
 
 
162 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2551  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
418 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  32.5 
 
 
156 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 
510 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
513 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1202  FHA domain containing protein  45.76 
 
 
161 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.75 
 
 
777 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.37 
 
 
448 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  37.84 
 
 
1029 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.84 
 
 
1029 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  44 
 
 
1108 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  41.03 
 
 
160 aa  45.8  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1298  FHA domain containing protein  40 
 
 
388 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1271  FHA domain containing protein  45.61 
 
 
177 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1146  FHA domain containing protein  34.88 
 
 
1456 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.65239  hitchhiker  0.000278165 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>