More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3061 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  314  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  65.12 
 
 
168 aa  216  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0050  FHA domain-containing protein  68.12 
 
 
156 aa  209  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00259691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  65 
 
 
155 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0034  FHA domain containing protein  54.02 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0023  FHA domain-containing protein  55.56 
 
 
153 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0068  FHA domain containing protein  55.29 
 
 
166 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  50.86 
 
 
179 aa  163  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  52.2 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  48.43 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0048  FHA domain-containing protein  53.75 
 
 
161 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0043  FHA domain-containing protein  53.75 
 
 
161 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140722  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0025  FHA domain-containing protein  47.59 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00410  FHA domain-containing protein  51.27 
 
 
156 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  49.07 
 
 
161 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10019  hypothetical protein  48.45 
 
 
155 aa  140  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0341337  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  47.24 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  45.96 
 
 
160 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0807  FHA domain-containing protein  51.55 
 
 
168 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  46.75 
 
 
166 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0025  FHA domain containing protein  47.17 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  54.89 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0028  FHA domain-containing protein  51.9 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0020  FHA domain-containing protein  48.73 
 
 
154 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0028  FHA domain-containing protein  48.73 
 
 
154 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377029  hitchhiker  0.00774619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0020  FHA domain-containing protein  48.73 
 
 
154 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.844855  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  43.68 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  42.7 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  45.77 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6476  FHA domain-containing protein  48.17 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  43.33 
 
 
170 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0032  FHA domain containing protein  54.4 
 
 
154 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  45.09 
 
 
175 aa  120  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1378  hypothetical protein  38.07 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  46.75 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0035  FHA domain protein  37.5 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0030  Forkhead-associated protein  55.36 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  44.17 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4519  hypothetical protein  49.35 
 
 
320 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  30.38 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  37.63 
 
 
267 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  29.59 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  39.47 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  30.25 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  29.03 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  34.09 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  36.07 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  35.16 
 
 
303 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  36.07 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27040  FHA domain-containing protein  30 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0909  FHA domain-containing protein  39.05 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  33.98 
 
 
316 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3386  FHA domain-containing protein  34.95 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0029589  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  38.32 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  32.61 
 
 
630 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  37.38 
 
 
1399 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  32.97 
 
 
279 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  27.39 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.1 
 
 
606 aa  58.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
1065 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  38.04 
 
 
1011 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1146  FHA domain containing protein  35.63 
 
 
1456 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.65239  hitchhiker  0.000278165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
894 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.59 
 
 
557 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15520  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 
147 aa  57.8  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.73 
 
 
554 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  27.85 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2047  Forkhead-associated protein  37.04 
 
 
814 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.445057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.73 
 
 
554 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  37.11 
 
 
863 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  30.1 
 
 
294 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  45.33 
 
 
408 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0057  FHA domain-containing protein  44.29 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00934225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  31.9 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  36.47 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  39.64 
 
 
414 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  35.48 
 
 
513 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0060  FHA domain-containing protein  43.21 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.399884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  27.33 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1589  FHA domain containing protein  36.27 
 
 
335 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  37.65 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.33 
 
 
878 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  36.56 
 
 
946 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  39 
 
 
1484 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  37.31 
 
 
252 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30 
 
 
566 aa  54.3  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2308  FHA domain-containing protein  24.38 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0512464  hitchhiker  0.000482709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.53 
 
 
554 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3956  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.62 
 
 
455 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1847  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.02 
 
 
675 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  35.29 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2501  FHA domain-containing protein  39.56 
 
 
306 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320482  decreased coverage  0.000381992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0026  FHA domain-containing protein  30.22 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>