More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2541 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2541  FHA domain-containing protein  100 
 
 
514 aa  1045    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.913197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
1519 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
780 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
1527 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.19 
 
 
1774 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3180  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
540 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.178138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.49 
 
 
1712 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
1527 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3252  sensor histidine kinase  25.09 
 
 
547 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3467  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
540 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
1527 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  26.32 
 
 
518 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154084  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0030  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 
533 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
1908 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.58 
 
 
1685 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.58 
 
 
1682 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.32 
 
 
2051 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
608 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
873 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 
469 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 
515 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.04 
 
 
1808 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  25.28 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  24.72 
 
 
1697 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
766 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0405  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.74 
 
 
1682 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  25.94 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  24.15 
 
 
523 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.61 
 
 
1901 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 
594 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  37.21 
 
 
387 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.56 
 
 
1780 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
958 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
765 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0853  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 
543 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0172043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  25 
 
 
595 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
511 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00545163  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.35 
 
 
1850 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.31 
 
 
1797 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.11 
 
 
1168 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.5 
 
 
598 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.86 
 
 
1780 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  23.99 
 
 
566 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
857 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  23.04 
 
 
509 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  23.04 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  24.68 
 
 
595 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
1123 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
553 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1797  FHA domain containing protein  43.9 
 
 
195 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1826  histidine kinase  25.14 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.778764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0021  histidine kinase  25.64 
 
 
485 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
832 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
559 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  24.68 
 
 
590 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
427 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.54 
 
 
604 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
595 aa  60.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
595 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  24.36 
 
 
595 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  25.54 
 
 
604 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
680 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
186 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.43 
 
 
1794 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  26.02 
 
 
518 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  44.62 
 
 
252 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  24.18 
 
 
912 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  23.72 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 
378 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  39.51 
 
 
158 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  42.03 
 
 
174 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
594 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.55 
 
 
1748 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  20.47 
 
 
1685 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
551 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.3 
 
 
1795 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  26.88 
 
 
600 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  34.72 
 
 
158 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  32.5 
 
 
456 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  25.51 
 
 
581 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
718 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  19.95 
 
 
1685 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  38.36 
 
 
219 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2137  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  25.62 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2227  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  25.62 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.025766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
612 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
353 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.55 
 
 
591 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1711  NifA subfamily transcriptional regulator  26.21 
 
 
608 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.478536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  42.86 
 
 
156 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  42.5 
 
 
167 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
581 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  24.19 
 
 
573 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 
844 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  37.68 
 
 
144 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>