192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2587 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  57.05 
 
 		 156 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  56.08 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  51.68 
 
 		 152 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  54.9 
 
 		 156 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  54.93 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  46.26 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  41.22 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.08 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  38.51 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.41 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  33.33 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.04 
 
 		 257 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.78 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.17 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  30.87 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  30.37 
 
 		 1048 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  29.13 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  26.23 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.71 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.59 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 		 231 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.58 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 		 239 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.07 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  28.78 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 257 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.23 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 230 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 226 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  34.52 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  27.86 
 
 		 633 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  47.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 243 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  26.62 
 
 		 454 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.66 
 
 		 243 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  27.91 
 
 		 245 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  23.77 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 		 857 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  31.96 
 
 		 731 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1486  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  21.53 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  26.36 
 
 		 381 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  24.6 
 
 		 286 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 412 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  31.5 
 
 		 261 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0631  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 241 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  25.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 250 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.59 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  28.09 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  34.41 
 
 		 860 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 228 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  32.94 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.62 
 
 		 230 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.62 
 
 		 230 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.27 
 
 		 419 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  28.09 
 
 		 227 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  22.22 
 
 		 225 aa  44.3  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>