More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2323 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  60.74 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  60.43 
 
 		 233 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  60.34 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  54.96 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  54.55 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  55.13 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  56.39 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  51.82 
 
 		 249 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 249 aa  235  7e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  51.49 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  54.7 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  52.08 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  55.13 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.2 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  53.45 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  53.31 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  50.64 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  52.3 
 
 		 241 aa  214  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  53.15 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.56 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  45.12 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  49.57 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  50.84 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  48.97 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  48.28 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  44.62 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  49.78 
 
 		 246 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  50.22 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  49.37 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  44.77 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  44.66 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  47.41 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  47.54 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  44.64 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  45.23 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  47.56 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  43.57 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  45.04 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  45.02 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  46.29 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  49.79 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.5 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  46.09 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.78 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  51.8 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  44.59 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  44.59 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  52.07 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  48.1 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  44.58 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  47.03 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  43.7 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  43.7 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  43.7 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  43.7 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  44.8 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  43.7 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  46.64 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  44.35 
 
 		 278 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  44.74 
 
 		 273 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  44.74 
 
 		 273 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  44.83 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.99 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  46.98 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  45.92 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  43.72 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  40.46 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  43.91 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  46.09 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  44.21 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  45.22 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  43.23 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  42.19 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  45.26 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  45.26 
 
 		 237 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  45.26 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  44.87 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  38.68 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  44.54 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  43.97 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  41.06 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  41.49 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>