More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2168 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  46.32 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  45.89 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  43.86 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  44.93 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  48.5 
 
 		 257 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  39.52 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  40.68 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  45.89 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  42.55 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  49.17 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  41.3 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  46.96 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  48.03 
 
 		 280 aa  187  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  43.84 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  44.02 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  47.52 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  47.35 
 
 		 276 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  44.16 
 
 		 269 aa  184  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  49.04 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  47.6 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  45.22 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.32 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  44.1 
 
 		 224 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.35 
 
 		 228 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  46.32 
 
 		 271 aa  181  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  47.83 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  47.62 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  48.67 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  45.76 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  42.49 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  42.5 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.34 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.48 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  44.21 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  43.51 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.6 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  41.05 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.37 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.26 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  41.71 
 
 		 202 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  38.26 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  45.5 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  39.06 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  41.45 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  45.49 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  47.92 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  39.21 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  37.66 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  47.91 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.96 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  36.52 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  36.19 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  40.69 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  36.84 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  43.72 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  45.54 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.52 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  36.52 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  36.52 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  36.52 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  36.52 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  47.08 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.67 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  46.09 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  35.59 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  39.05 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  43.04 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  43.42 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  42.17 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.43 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.53 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  44.78 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  36.52 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  35.62 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  40.93 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  36.48 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>