More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2340 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  36.48 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  31.01 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  37.6 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.93 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  31.73 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  27.37 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0896  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>