More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4369 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 424 aa  844    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  77.18 
 
 		 417 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  62.47 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  64.57 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  43.22 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  43.93 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  43.45 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  44.81 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  44.13 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  43.94 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  45 
 
 		 416 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  44.67 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  41.65 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  44.05 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  40.38 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  41.9 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  40.26 
 
 		 394 aa  269  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  37.44 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  39.14 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  39.19 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  30.18 
 
 		 374 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  30.18 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.27 
 
 		 376 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  30.22 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  30.45 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.78 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  29.4 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.87 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.87 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  30.1 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30.29 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  30.36 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.91 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  30.4 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  30.49 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  27.39 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  29.24 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  33.74 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30.08 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  31.22 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  30.37 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  29.06 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.61 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  29.74 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  29.74 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  29.02 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  29.82 
 
 		 383 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.5 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  29.59 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  25.4 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.09 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  29.21 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  28.8 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  30.66 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  29.87 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  29.19 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  32.97 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.97 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  30.85 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.25 
 
 		 363 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  28.53 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  29.58 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  30.13 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  29.02 
 
 		 375 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  28.07 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  27.54 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  28.07 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  27.59 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  27.9 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  29.61 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  31.1 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  25.62 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  25.87 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.81 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  31.68 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  27.96 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  28.64 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  25.91 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  35.41 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  26.92 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.51 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.72 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  26.21 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.99 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  25.06 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  28.31 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  29.92 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  25.65 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  26.57 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  26.36 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.2 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0672  peptidase M20  28.62 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.32 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  24.42 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0327  Acetylornithine deacetylase/Succinyl- diaminopimelate desuccinylase and related deacylase-like protein  27.68 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  35.42 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.02 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5271  peptidase M20  30.92 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>