125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0942 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  100 
 
 
324 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  59.15 
 
 
344 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  46.44 
 
 
338 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  45.82 
 
 
338 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  47.12 
 
 
339 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  34.65 
 
 
302 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  36.6 
 
 
304 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  38.14 
 
 
327 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  37.82 
 
 
430 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  32.25 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  39.44 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  39.44 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  35.91 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  35.9 
 
 
332 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.02 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.58 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  34.81 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  34.93 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  35.85 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  29.86 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  32.35 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  35.32 
 
 
269 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.22 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1297  putative lipase transmembrane protein  35.98 
 
 
246 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0202699  hitchhiker  0.00338477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  30.32 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.64 
 
 
195 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.64 
 
 
195 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  36.97 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  28.95 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  40.83 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  29.26 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  40.83 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  40.83 
 
 
287 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  29.06 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.32 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  33.9 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  29.03 
 
 
191 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  31.71 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  44.44 
 
 
357 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  31.71 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  31.71 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  31.71 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  31.71 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.69 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  25.25 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.8 
 
 
217 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  32.65 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  31.13 
 
 
216 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  26.61 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  21.58 
 
 
203 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  42.42 
 
 
414 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  31.75 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  30.1 
 
 
221 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  33.01 
 
 
211 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  28.93 
 
 
533 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  30.83 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  36.11 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  30.83 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  30.33 
 
 
533 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  30.89 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  31.19 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  26.57 
 
 
249 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  30.33 
 
 
533 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  29.92 
 
 
364 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1768  putative lipase transmembrane protein  32.52 
 
 
237 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  31.53 
 
 
332 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  33.67 
 
 
393 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06088  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
1161 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  28.1 
 
 
533 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  28.1 
 
 
533 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  23.77 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  30.53 
 
 
364 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  30.53 
 
 
364 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  30 
 
 
256 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  30.53 
 
 
364 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  30.33 
 
 
533 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  31.15 
 
 
533 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  22.31 
 
 
197 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  30.33 
 
 
533 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  50 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  31.51 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  31.51 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  35.79 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  33.87 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  38.46 
 
 
664 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  47.92 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  28.85 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  21.6 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  33.01 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  28.3 
 
 
216 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>