More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2729 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  49.64 
 
 		 701 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  100 
 
 		 689 aa  1379    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  52.66 
 
 		 703 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  51.36 
 
 		 701 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  49.49 
 
 		 701 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  50.76 
 
 		 701 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  51.21 
 
 		 701 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  49.49 
 
 		 701 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  44.35 
 
 		 722 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  45.26 
 
 		 757 aa  576  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  47.48 
 
 		 722 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  42.41 
 
 		 708 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  45.24 
 
 		 712 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  41.69 
 
 		 703 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  40.57 
 
 		 696 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  41 
 
 		 701 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  40.29 
 
 		 696 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  42.77 
 
 		 710 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  39.11 
 
 		 709 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  40.67 
 
 		 708 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  41.58 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 		 702 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  38.22 
 
 		 724 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 		 702 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.96 
 
 		 713 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  39.01 
 
 		 715 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  39.25 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  43.57 
 
 		 689 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 734 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  38.33 
 
 		 723 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  39.49 
 
 		 703 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 		 720 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  37.19 
 
 		 720 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 714 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.27 
 
 		 703 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  36.76 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  41.68 
 
 		 736 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  40.72 
 
 		 710 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  39.1 
 
 		 711 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 708 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 730 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  41.48 
 
 		 738 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 		 741 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 732 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 689 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.52 
 
 		 711 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 714 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  39.34 
 
 		 709 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 		 720 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 		 722 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 720 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  40.59 
 
 		 715 aa  422  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  39.28 
 
 		 710 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  36.63 
 
 		 699 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 707 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 		 850 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 815 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 		 796 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.65 
 
 		 817 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 796 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 837 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 796 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 862 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 864 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 796 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 843 aa  310  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 		 719 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 721 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 		 859 aa  300  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 860 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 677 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 714 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 		 708 aa  293  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 795 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  31.98 
 
 		 713 aa  293  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 742 aa  290  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 827 aa  290  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  31.7 
 
 		 713 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 795 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.48 
 
 		 724 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 858 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 863 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 810 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.89 
 
 		 706 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 726 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 855 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 855 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 825 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 825 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 882 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 726 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 881 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 881 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 679 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 		 881 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 709 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>