180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3637 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  56.65 
 
 		 652 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  100 
 
 		 664 aa  1323    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  59.48 
 
 		 647 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  53.67 
 
 		 653 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  53.54 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  51.43 
 
 		 643 aa  571  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  48.06 
 
 		 642 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  48.06 
 
 		 642 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  47.98 
 
 		 640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  47.67 
 
 		 640 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  48.26 
 
 		 642 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  54.68 
 
 		 649 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  43.95 
 
 		 645 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  41.71 
 
 		 653 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  43.11 
 
 		 657 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  39.08 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  37.01 
 
 		 652 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 636 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  39.48 
 
 		 633 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  38.47 
 
 		 647 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 647 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  36.2 
 
 		 683 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  36.83 
 
 		 632 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 631 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  39.37 
 
 		 652 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  39.25 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  37.54 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  47.37 
 
 		 254 aa  210  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  33.51 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  31.4 
 
 		 639 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  31.4 
 
 		 639 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  31.4 
 
 		 639 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  32.62 
 
 		 634 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  33.14 
 
 		 634 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  30.36 
 
 		 679 aa  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  32.57 
 
 		 413 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  34.27 
 
 		 396 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.63 
 
 		 603 aa  143  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  30.03 
 
 		 660 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.5 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  29.11 
 
 		 422 aa  133  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  29.65 
 
 		 696 aa  132  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  28.37 
 
 		 646 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  29.65 
 
 		 696 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  29.34 
 
 		 637 aa  130  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  25.72 
 
 		 570 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  25.72 
 
 		 570 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  29.49 
 
 		 696 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  26.72 
 
 		 647 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  28.02 
 
 		 691 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  33.2 
 
 		 273 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  31.79 
 
 		 846 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  29.21 
 
 		 782 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  31.51 
 
 		 779 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  27.84 
 
 		 743 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  33.51 
 
 		 308 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  26.33 
 
 		 820 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  32.5 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  32.06 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  38.82 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  33.49 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  30.05 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  28.77 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  44.96 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  31.6 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.09 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  32.33 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  26.83 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  30.09 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  28.42 
 
 		 284 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  33.02 
 
 		 280 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 128 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  28.22 
 
 		 325 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  28.91 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  31.34 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  29.58 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  30.99 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  27.69 
 
 		 284 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  30.33 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  30.33 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  45.88 
 
 		 128 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  24.5 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  31.46 
 
 		 283 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  28.18 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 128 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.18 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.38 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  29.25 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  43.82 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  29.71 
 
 		 291 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  32.86 
 
 		 702 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  27.36 
 
 		 304 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  30.69 
 
 		 307 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  32.72 
 
 		 279 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  30.99 
 
 		 276 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  30.99 
 
 		 276 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>