More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0030 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0405  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63.67 
 
 		 553 aa  703    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0030  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 533 aa  1087    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0853  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.11 
 
 		 543 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0172043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3180  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.18 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.178138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3252  sensor histidine kinase  54.48 
 
 		 547 aa  581  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3467  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 780 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  26.1 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 608 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 766 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 765 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 458 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  26.21 
 
 		 764 aa  136  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  31.28 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0915  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.84 
 
 		 800 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 655 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 655 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 1519 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  27.56 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  27.11 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  27.11 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  27.11 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  29.73 
 
 		 525 aa  100  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  25.76 
 
 		 604 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.76 
 
 		 604 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  26.67 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  26.22 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  26.67 
 
 		 458 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  27.73 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  26.22 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  27.54 
 
 		 647 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  27.73 
 
 		 465 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  27.73 
 
 		 465 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  27.05 
 
 		 655 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  27.27 
 
 		 465 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 551 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.39 
 
 		 679 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  27.27 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 510 aa  94  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  27.95 
 
 		 487 aa  94  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.61 
 
 		 747 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 661 aa  93.6  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 540 aa  93.2  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 339 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.92 
 
 		 747 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 408 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  25.59 
 
 		 539 aa  91.3  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 422 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 903 aa  91.3  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 553 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  26.19 
 
 		 656 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.79 
 
 		 598 aa  90.9  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 408 aa  90.9  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  26.96 
 
 		 581 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 656 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  24.47 
 
 		 673 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  26.07 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 929 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  26.24 
 
 		 661 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 551 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 1527 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.25 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 1527 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 494 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 480 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 515 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 674 aa  87.4  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.29 
 
 		 747 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  26.21 
 
 		 394 aa  86.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  26.41 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  26.81 
 
 		 1062 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.92 
 
 		 752 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 1527 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 564 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 1061 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.02 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  26.91 
 
 		 600 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 867 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  26.97 
 
 		 621 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  25.54 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  26.97 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 672 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  23.95 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0402  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93747  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  28.94 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>