More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2442 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 388 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  88.14 
 
 		 390 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  74.16 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  76.62 
 
 		 325 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  64.4 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  46.9 
 
 		 369 aa  301  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  42.29 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  40.38 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  44.44 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  51.52 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  39.68 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.35 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.71 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.25 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  34.3 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  35 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  39.3 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  39.11 
 
 		 322 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  38.31 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  34.12 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  37.76 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  32 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  36.76 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  36.68 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  32.63 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  33.78 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.22 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.22 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  34.95 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  40.19 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  35.78 
 
 		 324 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  30.04 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  35.91 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  35.91 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  37.71 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  35.44 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  36.04 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.16 
 
 		 328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  30.84 
 
 		 332 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  36.95 
 
 		 336 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  30.84 
 
 		 332 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  36.82 
 
 		 239 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  32.36 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.42 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.06 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  36.45 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  35.26 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.16 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  41.32 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  37.13 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  39.51 
 
 		 330 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  34.16 
 
 		 335 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  44.3 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.55 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  39.52 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  41.88 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  37.36 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  37.93 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  40 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  41.78 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  31.1 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  29.49 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  39.1 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  41.32 
 
 		 639 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  34.71 
 
 		 243 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 		 662 aa  102  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  40.4 
 
 		 814 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  44.52 
 
 		 613 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  37.23 
 
 		 641 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  33.97 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  39.07 
 
 		 829 aa  99.8  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  39.07 
 
 		 810 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.76 
 
 		 627 aa  98.2  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  35.07 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  27.86 
 
 		 644 aa  96.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.15 
 
 		 666 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.27 
 
 		 643 aa  96.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  28.24 
 
 		 647 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  30.81 
 
 		 804 aa  96.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  31.74 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  37.09 
 
 		 806 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  27.86 
 
 		 647 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  27.86 
 
 		 644 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  38.92 
 
 		 601 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  27.86 
 
 		 647 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  27.86 
 
 		 647 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  27.86 
 
 		 644 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.98 
 
 		 638 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  33.13 
 
 		 643 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>