140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0439 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  93.65 
 
 		 394 aa  713    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  784    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  64.23 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  59.64 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  50.86 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  53.28 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  50.24 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  49.45 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 326 aa  285  8e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.23 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.54 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  24.12 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.51 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  23.85 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  23.85 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  23.85 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.58 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  26.6 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  22.1 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.17 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  21.51 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25.84 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  22.91 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  22.91 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  22.91 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  22.08 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  27.86 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  27.86 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.99 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  23.83 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  23.53 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  20.16 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  21.33 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  24.66 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  24.09 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  20.3 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  18.61 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  24.41 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25.49 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.56 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  23.85 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  25 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  19.88 
 
 		 474 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  24 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.22 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.34 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.34 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.34 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>