More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0011 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  100 
 
 
208 aa  425  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  1.50276e-09  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  68.78 
 
 
206 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  6.92909e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  62.44 
 
 
205 aa  268  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  64.47 
 
 
207 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  68.6 
 
 
206 aa  262  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  9.28974e-07 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  63.9 
 
 
206 aa  261  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  65.05 
 
 
299 aa  261  5e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  52.2 
 
 
208 aa  182  2e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  54.26 
 
 
201 aa  181  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  48.35 
 
 
242 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.48 
 
 
250 aa  180  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  50.82 
 
 
199 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  52.75 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.75 
 
 
248 aa  178  5e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  49 
 
 
208 aa  178  5e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  51.89 
 
 
202 aa  178  6e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  53.19 
 
 
214 aa  178  6e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  54.95 
 
 
269 aa  177  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50 
 
 
199 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.91 
 
 
206 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.38708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.72 
 
 
203 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  54.92 
 
 
260 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.19683e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50 
 
 
256 aa  173  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  50.82 
 
 
191 aa  172  4e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  53.55 
 
 
198 aa  172  4e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  47.94 
 
 
255 aa  171  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.53 
 
 
202 aa  171  6e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  49.46 
 
 
268 aa  171  6e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.13775e-09  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.53 
 
 
202 aa  171  6e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.78 
 
 
240 aa  171  8e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  49.49 
 
 
235 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  51.09 
 
 
211 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  51.09 
 
 
212 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  50.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.79 
 
 
197 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49.74 
 
 
230 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  44.95 
 
 
232 aa  168  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.7081e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  52.69 
 
 
236 aa  168  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  51.09 
 
 
196 aa  167  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.72 
 
 
198 aa  167  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  52.2 
 
 
249 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.74 
 
 
283 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  52.2 
 
 
210 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  45.9 
 
 
225 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  51.63 
 
 
202 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  47.67 
 
 
199 aa  166  3e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  51.05 
 
 
214 aa  166  3e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  48.19 
 
 
283 aa  166  3e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  51.08 
 
 
229 aa  166  3e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  51.05 
 
 
214 aa  166  3e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  51.05 
 
 
214 aa  166  3e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  49.47 
 
 
240 aa  165  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  44.09 
 
 
198 aa  165  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.08633e-06  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  51.05 
 
 
214 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.53 
 
 
209 aa  165  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.53 
 
 
209 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  48.04 
 
 
198 aa  165  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.24 
 
 
308 aa  164  6e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  49.73 
 
 
216 aa  164  6e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  50 
 
 
203 aa  164  7e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.3 
 
 
201 aa  164  7e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  52.06 
 
 
224 aa  164  7e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.75 
 
 
201 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  49.24 
 
 
204 aa  164  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  46.03 
 
 
197 aa  164  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  49.75 
 
 
217 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  50.53 
 
 
217 aa  164  1e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  50.53 
 
 
217 aa  163  1e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.75 
 
 
218 aa  164  1e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  51.38 
 
 
207 aa  164  1e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.9 
 
 
257 aa  163  2e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.45 
 
 
277 aa  163  2e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.6 
 
 
255 aa  162  2e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  48.19 
 
 
283 aa  163  2e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  48.65 
 
 
212 aa  163  2e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.3 
 
 
207 aa  163  2e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  48.13 
 
 
199 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  47.8 
 
 
198 aa  162  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  47.89 
 
 
209 aa  162  4e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  51.1 
 
 
210 aa  162  5e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  54.1 
 
 
217 aa  161  5e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.56 
 
 
198 aa  162  5e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  2.94513e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  52.15 
 
 
232 aa  162  5e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  51.61 
 
 
232 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  49.73 
 
 
194 aa  161  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  46.15 
 
 
253 aa  161  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  49.19 
 
 
255 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.18 
 
 
253 aa  160  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  46.15 
 
 
254 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  54.59 
 
 
218 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.2 
 
 
208 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  46.6 
 
 
338 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.54 
 
 
219 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  53.85 
 
 
196 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.35 
 
 
198 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  49.47 
 
 
207 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.25 
 
 
257 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  47.67 
 
 
211 aa  157  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  45.88 
 
 
207 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50 
 
 
213 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>