More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2814 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  255  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  82.5 
 
 		 127 aa  211  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  78.86 
 
 		 144 aa  207  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  80 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  80 
 
 		 126 aa  206  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  77.5 
 
 		 126 aa  203  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 126 aa  203  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  77.5 
 
 		 121 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  75 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  75 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  77.5 
 
 		 121 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  75 
 
 		 123 aa  196  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  73.55 
 
 		 134 aa  196  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  74.17 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  75 
 
 		 121 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  75 
 
 		 121 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  75.83 
 
 		 121 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  75 
 
 		 121 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  71.67 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  68.33 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 120 aa  153  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  48.33 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 1274 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1352 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  46.15 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1271 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 397 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 		 497 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 1172 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1977 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  37.7 
 
 		 742 aa  97.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 948 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  43.97 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1044 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1245 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1362 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1016 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  39.84 
 
 		 762 aa  92.8  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 902 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  42.37 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1070 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  41.53 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.68 
 
 		 236 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 		 763 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 1160 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  39.32 
 
 		 248 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1007 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  38.26 
 
 		 1297 aa  90.5  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 967 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.82 
 
 		 1233 aa  90.1  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  41.03 
 
 		 1361 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  39.32 
 
 		 1188 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0392  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 869 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1236 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1236 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1236 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1236 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1096 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>